别急,这事儿其实有章可循,今天我就给你把路子捋清楚,让你少走弯路,直接找到对自己有用的东西。
先分清楚你到底是“要学说话”还是“要看报表”
这是新手最容易翻车的地方,没有之一。
你想要的“医疗数据”其实分两种,天差地别:
- 训练文本语料:这是给模型“喂”的,让它学会识别“咳嗽”、“肺炎”、“阿莫西林”这些词之间的关系,能看懂医患对话、抽取病历信息。你要找的是类似“患者咳嗽三天,咳黄痰”这样的句子集合。
- 卫生统计数据:这是给人看的报表,比如“2023年全国肺炎发病率为X%”、“某三甲医院月门诊量Y人次”。这些数字是统计结果,拿来画图表做分析行,但你拿它训模型,模型学不会“什么是咳嗽”。
记住一条死理:千万别拿年鉴去训NER(命名实体识别),学不出来,浪费时间。
找中文医学文本,这几个地方是“真·重点”
如果你的目标是做中文医疗NLP,下面几个入口是绕不开的硬通货,比你自己瞎搜强百倍。
1. CBLUE(天池平台)—— 中文医疗NLP的“高考题库”
链接:https://tianchi.aliyun.com/dataset/95414
这是阿里云天池上由中文信息学会搞的基准评测,基本算事实上的行业标准。涵盖了实体识别、关系抽取、文本分类、医学问答等8个子任务。你如果不知道从哪下手,就从这开始。要在天池注册个账号才能下,很简单,没门槛。
2. CMeEE(天池平台)—— 入门级NER“教科书”
链接:https://tianchi.aliyun.com/dataset/144495
如果你想先让模型学会“认出”疾病、药物、身体部位这些实体,这个数据集很合适。把疾病、临床表现、药物等9类标得清清楚楚。同样在天池下载。
3. 医患对话(Hugging Face上现成的)
链接:https://huggingface.co/datasets/UCSD26/medical_dialog
想做问答模型或者对话系统?这个数据集是纯中文的医患对话,直接就能用,不用签协议,对新手极其友好。用datasets库就能加载进代码。
别自己瞎找,先看这些“总目录”
医疗NLP的源头太散了,有人把家底都给你列好了。打开下面这几个GitHub仓库,相当于拿到了一份“藏宝图”。
- GanjinZero/awesome_Chinese_medical_NLP:https://github.com/GanjinZero/awesome_Chinese_medical_NLP
- FreedomIntelligence/Medical_NLP:https://github.com/FreedomIntelligence/Medical_NLP
重要提醒:这俩是“地图”,不是“金矿”。 里面列了很多链接,但有些是需要申请的,有些可能已经失效了。你得顺着地图一个个去点开核实,别幻想点一个就能全部下载。
如果只能找到英文,或者中文的拿不到怎么办?
国内很多真实病历数据都管得很严,要资质审核、签协议,不是你随便就能下的。如果暂时搞不定,可以用下面这些没有门槛的英文数据先练练手:
- MeDAL(医学缩写消歧数据集):https://github.com/McGill-NLP/medal
英文,但体量大,免费下,适合先做预训练,让你的模型先熟悉“医学语言的感觉”。
- MultiCaRe(多模态病例报告):介绍页在 https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10792687/,数据托管在Zenodo。由7万多篇开放获取的病例报告提炼出来的,有近10万个病例,免费。
最后,说个不是办法的办法
说实话,医疗NLP数据最大的麻烦不是“有没有”,而是“能不能拿到”。有的点开就下,有的要注册,有的得签保密协议,有的只对医院开放。你一个人挨个去试,光是搞清楚每个数据的准入门槛,就够折腾一周。
假如你不想把精力耗在这种零碎的试错上,想直接知道“哪个数据我能用、哪个我肯定拿不到”,可以留意一下数聚天成DeepSData。他们能帮你做“数据可得性深度检索”——意思就是,你把需求告诉他,他替你去那些散落各处的源头(天池、GitHub、PhysioNet、卫健委等等)里捞一遍,然后诚实地告诉你:哪个能直接下,哪个需要去考个证、签个协议才能拿,哪个根本就是画饼。省掉你一个个去踩坑的时间。至于要不要用,你自己决定——但至少知道有这么一个搜法在。
本文仅作公开来源整理和可得性参考,不构成医疗、法律、投资、商业决策或合规意见;正式使用前请以官方页面、授权条款和专业意见为准。
说明:本文为公开资料整理,仅供参考;平台政策、价格、下载方式与链接随时可能变化,本文不保证持续更新,请以各官方页面最新信息为准。
参考来源
- https://tianchi.aliyun.com/dataset/95414
- https://tianchi.aliyun.com/dataset/144495
- https://github.com/GanjinZero/awesome_Chinese_medical_NLP
- https://github.com/FreedomIntelligence/Medical_NLP
- https://github.com/zonghui0228/BioMedical-NLP-corpus
- https://huggingface.co/datasets/UCSD26/medical_dialog
- https://aistudio.baidu.com/datasetoverview
- https://www.kaggle.com/datasets/jpmiller/layoutlm
- https://physionet.org/
- https://www.physionet.org/content/mimic-iv-note/view-license/2.2/
- https://n2c2.dbmi.hms.harvard.edu/data-sets
- https://www.i2b2.org/NLP/DataSets/
- https://www.who.int/data/gho
- https://data.worldbank.org/topic/health
- https://www.nhc.gov.cn/mohwsbwstjxxzx/tjzxtjsj/tjsj_list.shtml
- https://github.com/McGill-NLP/medal
- https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10792687/
